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Des chercheurs trouvent des indices sur de nouveaux mécanismes pour les infections à coronavirus

Un groupe de virus de chauve-souris liés au SRAS-CoV-2 peut également infecter les cellules humaines, mais utiliser une passerelle différente et inconnue.

Alors que les chercheurs étudient toujours comment ces virus infectent les cellules, les découvertes pourraient aider au développement de nouveaux vaccins qui empêchent les coronavirus de provoquer une autre pandémie.

Parution dans le journal, eBioMédecine, une équipe de chercheurs de la Washington State University a utilisé une approche informatique basée sur la science des réseaux pour distinguer un groupe de coronavirus qui peuvent infecter les cellules humaines de ceux qui ne le peuvent pas. Les chercheurs ont ensuite confirmé les résultats de leurs calculs en laboratoire, montrant qu’un groupe spécifique de virus peut infecter à la fois les cellules humaines et celles de chauve-souris.

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“Ce que nous voyons avec ces virus, c’est qu’ils peuvent pénétrer dans les cellules par un autre mécanisme ou récepteur, et cela a beaucoup d’implications sur comment et s’ils pourraient nous infecter”, a déclaré Michael Letko, co-directeur. auteur et professeur adjoint à la Paul Allen School of Global Health.

La transmission interspécifique des coronavirus représente une menace sérieuse pour la santé mondiale. Alors que de nombreux coronavirus ont été découverts dans la faune, les chercheurs ont été incapables de prédire lequel représente la plus grande menace pour les humains et se démènent pour développer des vaccins après la propagation des virus.

“Alors que nous envahissons de plus en plus d’endroits où il y a des interactions homme-animal, il est très probable qu’il y aura de nombreux virus qui devront être examinés”, a déclaré Shira Broschat, professeur à l’École de génie électrique et d’informatique. , également co-auteur principal de l’article.

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Le SRAS-CoV-2, le virus à l’origine de la pandémie en cours, est l’un des nombreux virus apparentés qui utilisent leur protéine de pointe pour infecter les cellules en se liant à une protéine réceptrice appelée enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2). Les récepteurs ACE2 se trouvent dans de nombreux types de cellules et de tissus humains, notamment les poumons, le cœur, les vaisseaux sanguins, les reins, le foie et le tractus gastro-intestinal. Dans des études précédentes, Letko a montré qu’un autre groupe de sarbecovirus, la famille à laquelle appartient le SRAS CoV-2, peut également infecter les cellules humaines. Comment ils font cela reste un mystère. Les Sarbecovirus sont présents chez les chauves-souris et d’autres mammifères à travers le monde.

Les chercheurs ont commencé avec une base de données contenant plus de 1,6 million d’entrées de sarbecovirus. Pour mieux comprendre ce qui distingue les virus animaux qui peuvent infecter les cellules humaines de ceux qui ne le peuvent pas, les chercheurs ont construit des cartes de réseau montrant la relation des séquences de pointes virales. Lorsque l’équipe a concentré son attention sur une petite partie de la protéine de pointe utilisée par certains coronavirus pour se lier aux récepteurs, ils ont découvert que leur carte de réseau avait organisé les virus en groupes qui séparaient ceux qui peuvent infecter les cellules humaines de ceux qui ne le peuvent pas.

“Beaucoup de gens séquencent les génomes parce que c’est assez bon marché et facile à faire, mais vous devez donner un sens à tout ce séquençage”, a déclaré Broschat. « Nous devons comprendre les relations entre les séquences. »

Avec cette minuscule région de la protéine de pointe en vue, les chercheurs se sont tournés vers le laboratoire. L’équipe de Letko se spécialise dans l’étude de la façon dont les virus infectent les cellules et a pu montrer que cette région de la protéine de pointe peut en fait permettre à des particules non infectieuses de type viral d’envahir les cultures de cellules humaines. Les résultats de laboratoire approfondis de l’équipe ont confirmé l’exactitude de la carte du réseau.

Les chercheurs ne savent pas encore quels récepteurs sont impliqués et si cette voie d’infection est suffisamment efficace pour que la transmission inter-espèces se produise, mais ils ont identifié une région dans les pics de virus qui semble essentielle pour déterminer comment elle peut infecter quel groupe de virus. virus. plusieurs types de cellules différents dans plusieurs espèces différentes – des informations qui seront essentielles pour le développement de vaccins.

Les chercheurs espèrent qu’à mesure que de nouveaux virus de cette famille de virus seront découverts, les scientifiques pourront les examiner par ordinateur et faire une prédiction de ce qu’ils feront en laboratoire.

“C’est comme un roman policier : vous chassez et vous chassez, et vous obtenez l’histoire de plus en plus claire”, a déclaré Broschat. « Alors, qui est le méchant ? » »

Le travail a été financé par WSU et la Paul G. Allen School for Global Health.

Source de l’histoire :

Matériaux fourni par Université de l’État de Washington. Original écrit par Tina Hilding. Remarque : le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.

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